雖然只有50萬元的創業資本，馬云還是認為未來的公司應該具有俯瞰世界的眼光和氣魄，所以名字也應該是響亮的、國際化的。
為了給網站起個好名字，馬云思索了很久。直到有一次馬云去美國出差，在餐廳吃飯的時候，他突然想到，互聯網就像一個無窮的寶藏，等著人們去發掘。這時他想到了《一千零一夜》中“阿里巴巴”的故事。故事中，善良的阿里巴巴憑著一句“芝麻開門”打開了通往財富的大門，而馬云他們的宗旨是要為商人們敲開財富的大門。想到這，馬云很興奮。
馬云找來餐廳的侍應生，問他是否知道阿里巴巴這個名字。侍應生說：“Yes，Alibaba——OpenSesame�。ㄎ抑�，阿里巴巴——芝麻開門�。�
馬云問了很多人，幾乎所有人都知道阿里巴巴的故事。從美國人到印度人，只要懂英語，就能拼出“Alibaba”。而且，不論語種，發音也近乎一致。就這樣，一錘定音，馬云將阿里巴巴確定為公司的名字。
正當馬云為自己想出了這樣一個美妙的名字而興高采烈地去注冊域名時，卻被告知“阿里巴巴”已經名花有主了。據了解，這個域名兩年前被一個加拿大人搶先注冊了。
雖然當時馬云手中只有50萬元創業資本，他卻不惜花費1萬美元從那個加拿大人手中買回了阿里巴巴的域名。雖然代價不菲，但與Google斥資百萬贖回兩個CN域名相比，馬云當初的花費還是值得的。
而有趣的是，有著理想主義的馬云同時將alimama.com、alibaby.com域名注冊下來。他說：“阿里爸爸、阿里媽媽、阿里貝貝本來就應該是一家�！�
馬云將網站取名為“阿里巴巴”其實有更深一層的含義，他說：“叫阿里巴巴不僅僅是為了中國，也為了全球。我們的事業不僅是為了賺錢，而是為了創建一家全球化的、可以做102年的優秀公司�！�
眼光獨特的馬云在當時就已深刻認識到，亞洲人應該有自己的電子商務模式，而當時所有的電子商務都是大企業的電子商務，亞洲獨特的電子商務不應該是簡單的B2B（BusinessToBusiness），而應是商人對商人（BusinessmanToBusinessman）。這是亞洲人獨創的模式。阿里巴巴就是為中小企業免費登信息，“以后也將永遠免費”。
按照馬云的想法，阿里巴巴應由網上論壇BBS按行業分類發展而來，如前文所述，團隊的其他人卻并不同意他的做法，甚至拍著桌子同馬云吵。馬云再三思考，還是覺得自己對，于是他堅持自己的想法，強制其他成員按照自己的決定去執行。因此，盡管意見相左，但最后阿里巴巴還是按照馬云的構想逐步建立起來了。
經過幾個月的籌備建設，www.alibaba.com在互聯網上出現了，效益也越來越好。
一位青島商人，每年從韓國進口一種設備，他堅信設備的產地其實就在中國，但他一直無法找到中國廠家。后來他偶然發現了阿里巴巴，就在上面發了一條求購信息，不料幾天之內就同該設備的中國廠家聯系上了！令他驚奇的是，該廠家竟然就在青島！
有一家東北生產小商品的企業，將他的產品信息放到阿里巴巴上尋找買家。一年下來，他們46個買家中有44個來自阿里巴巴網站！
一傳十，十傳百，阿里巴巴在商業圈中聲名鵲起。而馬云知道，國內電子商務尚不成熟，只有利用發達國家已深入人心的電子商務觀念，為外貿服務，才能得到真正利潤豐厚的大魚。于是，阿里巴巴開設了一個專區“中國供應商”，把中國大量的中小型出口加工企業的供貨信息，以會員形式免費向全球發布。就這樣，阿里巴巴走向了世界。
